1985年上海市中医药研究院成立，目前与上海中医药大学实行两块牌子、一套管理机构，学校校级领导兼任研究院院级领导的管理体制。 学校位于浦东新区张江高科技园区科研教育区内，占地500余亩，教学设施齐全、环境优美，在上海建设“创新型城市”战略布局中，已成为“张江药谷”的重要组成部分。 建校以来，为国家培养和输送了各级各类中医药专门人才，校友遍布60多个国家和地区。学校拥有600多名专家和教授，3名两院院士，76名全国老中医药专家学术经验继承班指导老师，60名上海市名中医。1999年，学校首批通过了教育部“本科教学工作优秀学校”的评估，并于2007年再次被评为“优秀”。综合实力位居全国中医院校前列。学校是国家教育部“人才培养模式创新实验区”和“特色专业点”建设高校。