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 收藏人
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已过期
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会议通知
主办方：北京市计算中心 生物计算事业部
会议日程
（最终日程以会议现场为准）
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日期
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授课题目
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授课内容
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第一天
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生物信息学导论
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1．生物信息学发展简史（重点讲解）
2．生物信息学主要研究领域（重点讲解）
3．生物信息学软件和工具
4．生物信息学重要会议
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生物信息学基础（上机操作）
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1、linux基础
掌握Linux系统下的常用命令(重点)
掌握linux环境下软件的安装使用
了解shell脚本的编写
2、perl基础
介绍Perl 的基本元素
Perl在生物信息中应用示例(DN复制、DN转录、RN翻译)
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第二天
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二代测序技术原理及基因组拼接
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1、介绍目前主流二代测序仪的测序原理
2、主要操作流程及特点
3、序列拼接的技术方法
4、常用软件及全基因组个性化组装的技巧
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基因组拼接组装（以细菌/病毒为例）（上机操作）
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1、全基因组组装的流程介绍
2、原始测序数据的预处理
3、分别介绍Velvet和SOPdenovo的使用，并以一株细菌的测序数据为例进行组装
4、介绍Newbler的是使用，并以一个IonTorrent测序的噬菌体数据为例进行组装
5、以细菌的数据为例,介绍填补gap的方法，包括延伸法，局部拼接法
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第三天
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基因组重测序与数据分析
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1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用
2、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识
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基因组重测序数据分析实例（上机操作）
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1、对二代测序数据的解读
2、数据质量控制及数据过滤
3、使用W和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化（重点讲解）
4、寻找SNP和Indel并进行注释（重点讲解）
5、寻找结构变异并对变异进行注释（重点讲解）
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第四天
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转录组测序与数据分析
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1、转录组基本概况和技术发展简介
2、转录组技术流程及技术细节（重点讲解）
3、转录组应用案例
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转录组数据分析实例（上机操作）
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1、转录组数据准备和软件介绍及安装
2、转录组数据的比对（重点讲解）
3、表达量估计和分析（重点讲解）
4、后续功能分析简介
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第五天
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microRN测序与数据分析
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1、microRN目前的应用、发展历史以及microRN的定义
2、microRN的生物学过程（重点讲解）
3、microRN的测序（重点讲解）
4、microRN测序数据分析软件（重点讲解）
5、microRN目前的挑战以及将来的研究前景
6、microRN测序数据分析案例展示（重点讲解）
7、近期文献
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microRN数据分析实例（上机操作）
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1、microRN测序数据预处理（重点讲解）
2、测序数据长度分布计算
3、microRN的预测（重点讲解）
4、microRN碱基偏好性计算
5、microRN靶标基因预测，结果提取、统计（重点讲解）
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蛋白质组信息学平台及应用
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1、蛋白质鉴定的质量控制
2、非限制性蛋白质翻译后修饰鉴定
3、蛋白质定量分析
4、蛋白质组数据管理
5、案例分析
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(课程内容以实际授课为准)
会议嘉宾
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主办方没有公开参会单位
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